Tylko samice o najwyższej wartości genetycznej są matkami potencjalnych buhajów inseminacyjnych. Kryteria wyboru takich samic zapisane są w programach hodowlanych. PFHBiPM prowadzi księgi hodowlane i realizuje programy hodowlane dla dziewięciu ras bydła mlecznego, jednak nie we wszystkich rasach wybierane są matki buhajów.
Jeszcze w tym roku powinien zostać przyjęty i wdrożony w życie Program hodowli koni w Polsce, który będzie pierwszym i jedynym tego typu dokumentem w kraju.